More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0515 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
396 aa  791    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  53.77 
 
 
354 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  52.57 
 
 
354 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  50.39 
 
 
360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  46.51 
 
 
355 aa  322  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  45.71 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.64 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  43.86 
 
 
354 aa  305  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.67 
 
 
355 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  42.67 
 
 
355 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  43.6 
 
 
354 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.84 
 
 
372 aa  278  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.43 
 
 
355 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  38.74 
 
 
376 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  37.79 
 
 
370 aa  247  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  39.37 
 
 
352 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  39.43 
 
 
369 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  36.86 
 
 
369 aa  223  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.99 
 
 
368 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.73 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.24 
 
 
350 aa  219  7e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  35.86 
 
 
347 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  34.07 
 
 
386 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  33.91 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.46 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.96 
 
 
448 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  33.25 
 
 
370 aa  211  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  33 
 
 
383 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 
357 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.82 
 
 
368 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  30.94 
 
 
439 aa  207  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  34.67 
 
 
354 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.52 
 
 
385 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  34.63 
 
 
338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  32.45 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 
347 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  34.27 
 
 
373 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  31.9 
 
 
375 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.83 
 
 
383 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.48 
 
 
455 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.88 
 
 
361 aa  193  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  34.01 
 
 
383 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
339 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.84 
 
 
383 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.76 
 
 
383 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  28.83 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  34.35 
 
 
386 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  34.35 
 
 
386 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  31.9 
 
 
377 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  33.5 
 
 
373 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.34 
 
 
332 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.99 
 
 
383 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  34.35 
 
 
386 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  32.68 
 
 
451 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  30.39 
 
 
337 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.8 
 
 
450 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  34.37 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.02 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  33.33 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  35.77 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  33.85 
 
 
450 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  31.35 
 
 
450 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.15 
 
 
372 aa  182  9.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.25 
 
 
392 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.46 
 
 
343 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 
367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  33.84 
 
 
367 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.59 
 
 
383 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  30.68 
 
 
452 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.94 
 
 
456 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.59 
 
 
450 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.52 
 
 
452 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  30.15 
 
 
380 aa  177  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.97 
 
 
366 aa  177  4e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  32.15 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  32.89 
 
 
325 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  33.25 
 
 
384 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.96 
 
 
351 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.13 
 
 
455 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  30.04 
 
 
457 aa  170  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  30.92 
 
 
454 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  31.39 
 
 
454 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.71 
 
 
374 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  31.97 
 
 
341 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.04 
 
 
457 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  28.63 
 
 
494 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  33.69 
 
 
351 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.31 
 
 
450 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  31.49 
 
 
451 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.91 
 
 
449 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.87 
 
 
451 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  33.69 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  31.26 
 
 
451 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  31.26 
 
 
451 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.81 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  30.83 
 
 
362 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  31.88 
 
 
365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.63 
 
 
347 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>