More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0152 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0152  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  56.57 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  39.53 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  44.88 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  48.57 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  43.2 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 127 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  50.47 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  41.13 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  43.22 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  48.54 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  41.86 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  47.52 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  45.31 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  48.7 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  40.34 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  45.63 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  40.48 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 123 aa  103  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  48.54 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 128 aa  103  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  45.54 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  41.13 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  43.8 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  40.34 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  41.32 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  39.5 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0984  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.052829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  43.7 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  44.09 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  42.02 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  42.97 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>