More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0984 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0984  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.052829  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  45.08 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 135 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 		 129 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  43.09 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 126 aa  106  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  41.53 
 
 		 125 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  49.52 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  47.22 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  48.11 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  45.08 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  42.59 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 129 aa  103  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  45.69 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.79 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  43.08 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  42.15 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0152  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  41.94 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  45.71 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  46.6 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  41.22 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  42.02 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  40 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  41.32 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>