119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2879 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0713  glycosyl transferase family 2  38.93 
 
 
307 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0712  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
307 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
271 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
701 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
605 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
974 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
1562 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
274 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
285 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
265 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
1037 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
261 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
261 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
279 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.72 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  26.16 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
718 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  25.49 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3292  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  22.55 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  24.89 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  24.13 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  24.17 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
252 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
274 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  23.77 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  21.32 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  24.56 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 
258 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.33 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
272 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
272 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
249 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  23.13 
 
 
255 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
269 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
338 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
235 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
246 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.54 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  20.82 
 
 
317 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
544 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  22.88 
 
 
300 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
257 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
284 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
364 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0400  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
275 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  21.26 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  25.85 
 
 
249 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  24.02 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.73 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  20.58 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
320 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  20.33 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
597 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.86 
 
 
466 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
248 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.89 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
1250 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.4 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>