159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0713 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0713  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 307 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0712  glycosyl transferase family 2  70.68 
 
 		 307 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  38.93 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 1562 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 605 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 		 701 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 974 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 274 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 1037 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  28.39 
 
 		 267 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  26.45 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  23.15 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3292  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  29.81 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  25.22 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  22.47 
 
 		 1523 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  23.29 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  36.47 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  24.35 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.12 
 
 		 329 aa  52.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 361 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.33 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 		 1523 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  32.43 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  32.43 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.55 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  21.43 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  19.46 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  33.04 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  33.04 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  31.53 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  33.04 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  31.58 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>