185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0712 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0712  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 307 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0713  glycosyl transferase family 2  70.68 
 
 		 307 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  40.16 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 1562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 		 701 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 605 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 974 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 1037 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  35.12 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.52 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  29.01 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  29.54 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  23.97 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  26.94 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3292  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.94 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 718 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  23.91 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.53 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  23.53 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  21.21 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 1032 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  26.27 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2601  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  22.84 
 
 		 581 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  23.11 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1074  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  20.27 
 
 		 236 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  21.22 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  20.35 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  22.53 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  19.62 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 		 1250 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  21.21 
 
 		 672 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  23.05 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>