176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2704 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 262 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.83 
 
 		 251 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.76 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2247  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.27 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2258  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.43 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.77 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.2 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  28.25 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  31.5 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  28.84 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  30.37 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  31.5 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.55 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  31.5 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  31.5 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.45 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.83 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.41 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.28 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.13 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.06 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.91 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.26 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.2 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.04 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.34 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.04 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.46 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.84 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.05 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.13 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.72 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  29.73 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.9 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.74 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.25 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.9 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  33.9 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.29 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.7 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.71 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.54 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.37 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.39 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.56 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.83 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.92 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.77 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  30.4 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.31 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  24.12 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.34 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  26.86 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.42 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.06 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  33.08 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.53 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.12 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.38 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.15 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  33.65 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  25.98 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.38 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.87 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  32.12 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  31.54 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  30.72 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.59 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  22.61 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  25.85 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.04 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  28.97 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.2 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  33.68 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  30.77 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  33.68 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  33.68 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.26 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.53 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.17 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.49 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  26.99 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  37.35 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.46 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  54.55 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  32.45 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>