More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1452 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  60.28 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  56.07 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  54.67 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  52.13 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.93 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1541  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.59 
 
 		 527 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.91 
 
 		 511 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.91 
 
 		 511 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  36.99 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.15 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  36.99 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  39.15 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  36.92 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1598  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  38.76 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 243 aa  151  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1211  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00218748  normal  0.15361 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.44 
 
 		 480 aa  148  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  38.86 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  41.15 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.38 
 
 		 526 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  36.24 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  35.16 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.7 
 
 		 516 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  35.07 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  37.04 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.14 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.14 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 251 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.24 
 
 		 516 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.73 
 
 		 483 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  39.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>