More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2678 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
184 aa  384  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  75.88 
 
 
174 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  62.43 
 
 
174 aa  226  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  58.72 
 
 
174 aa  218  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  52.44 
 
 
177 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
164 aa  104  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  36.99 
 
 
237 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  39.51 
 
 
183 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  39.51 
 
 
183 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  39.51 
 
 
183 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  39.51 
 
 
183 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  39.51 
 
 
183 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  36.99 
 
 
237 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  39.51 
 
 
183 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  38.89 
 
 
183 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 
183 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  36.47 
 
 
188 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 
183 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 
183 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 
183 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
216 aa  95.9  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
177 aa  95.9  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
175 aa  94.4  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  36.84 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  34.9 
 
 
161 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 
177 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  30.72 
 
 
170 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  31.37 
 
 
170 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  31.37 
 
 
170 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 
186 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  30.72 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  29.22 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  30.72 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  30.32 
 
 
169 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  30.72 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  29.87 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  28.57 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 
177 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  29.22 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  29.22 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  29.22 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  31.51 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  32.68 
 
 
166 aa  82  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.39 
 
 
359 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.66 
 
 
359 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.03 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  27.39 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  27.39 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  27.39 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  27.39 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  28.03 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  27.39 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  30.38 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.76 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  33.33 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  26.92 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  27.04 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.71 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  29.93 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.56 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
233 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  32.54 
 
 
217 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 
214 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  34.02 
 
 
217 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
222 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 
226 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 
226 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  24.39 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>