265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3046 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 833 aa  1697    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 		 872 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.77 
 
 		 887 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  37.05 
 
 		 906 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.69 
 
 		 967 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.2 
 
 		 864 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.23 
 
 		 894 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.33 
 
 		 894 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2269  (Protein-PII) uridylyltransferase  30.96 
 
 		 818 aa  301  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.53 
 
 		 930 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.97 
 
 		 905 aa  297  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  28.59 
 
 		 898 aa  296  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.65 
 
 		 930 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  28.31 
 
 		 931 aa  292  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 936 aa  292  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 930 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  27.53 
 
 		 899 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.94 
 
 		 924 aa  284  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.55 
 
 		 937 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 927 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  28.34 
 
 		 902 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.18 
 
 		 930 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 943 aa  282  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.18 
 
 		 930 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  28.69 
 
 		 938 aa  279  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  28.91 
 
 		 937 aa  278  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  28.66 
 
 		 906 aa  277  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.41 
 
 		 934 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  28.45 
 
 		 932 aa  271  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.18 
 
 		 930 aa  271  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  27.92 
 
 		 928 aa  271  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  28.05 
 
 		 928 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.28 
 
 		 900 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  28.05 
 
 		 928 aa  270  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  27.12 
 
 		 934 aa  270  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.99 
 
 		 933 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.99 
 
 		 934 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.43 
 
 		 933 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  27.13 
 
 		 925 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  28.38 
 
 		 936 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  30.84 
 
 		 899 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.34 
 
 		 931 aa  265  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.06 
 
 		 931 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  28.38 
 
 		 935 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.73 
 
 		 893 aa  262  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  27.62 
 
 		 969 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  27.23 
 
 		 936 aa  261  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  27.6 
 
 		 931 aa  260  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  29.09 
 
 		 1029 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.1 
 
 		 912 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  28.13 
 
 		 968 aa  258  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.62 
 
 		 893 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  29.32 
 
 		 989 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  29.53 
 
 		 861 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  30.31 
 
 		 889 aa  253  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.3 
 
 		 863 aa  251  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  28.48 
 
 		 941 aa  250  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.39 
 
 		 968 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  27.76 
 
 		 949 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 852 aa  247  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 862 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  29.03 
 
 		 875 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.32 
 
 		 914 aa  246  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 862 aa  245  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 858 aa  244  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  29.54 
 
 		 859 aa  244  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.96 
 
 		 894 aa  244  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  28.18 
 
 		 851 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  28.23 
 
 		 887 aa  243  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 897 aa  242  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 858 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  28.75 
 
 		 858 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28 
 
 		 935 aa  241  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  27.38 
 
 		 856 aa  241  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  27.76 
 
 		 874 aa  241  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  28.82 
 
 		 858 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  28.82 
 
 		 858 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  28.69 
 
 		 858 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  27.71 
 
 		 892 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  29.33 
 
 		 859 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2942  PII uridylyl-transferase  28.55 
 
 		 868 aa  239  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 		 941 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  27.27 
 
 		 881 aa  238  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 858 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 858 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  26.24 
 
 		 895 aa  238  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 858 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 858 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 858 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 858 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  27.78 
 
 		 858 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  28.61 
 
 		 858 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  27.54 
 
 		 899 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  27.76 
 
 		 859 aa  234  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 858 aa  234  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  27.68 
 
 		 857 aa  234  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  26.84 
 
 		 874 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2422  PII uridylyl-transferase  28.92 
 
 		 863 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  25.68 
 
 		 912 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  27.27 
 
 		 881 aa  232  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>