87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1667 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1667  hypothetical protein  100 
 
 
569 aa  1161    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  31.47 
 
 
511 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  31.38 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3148  hypothetical protein  35.05 
 
 
515 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.358064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  34.24 
 
 
520 aa  154  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  29.94 
 
 
515 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  29.68 
 
 
502 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  37.41 
 
 
508 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  35.11 
 
 
538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  35.33 
 
 
538 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  28.1 
 
 
570 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  35 
 
 
538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  28.26 
 
 
570 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  29.47 
 
 
601 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  30.67 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  30.37 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  33.33 
 
 
537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
569 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  27.92 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  31.01 
 
 
336 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  36.72 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  28.9 
 
 
768 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  27.14 
 
 
282 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.25 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  31.14 
 
 
323 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  27.7 
 
 
336 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  25.24 
 
 
611 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  27.02 
 
 
338 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  25.59 
 
 
279 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  26.76 
 
 
922 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  24.12 
 
 
276 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  26.97 
 
 
245 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  32.41 
 
 
223 aa  55.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  32.95 
 
 
230 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  26.26 
 
 
359 aa  54.7  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  34.56 
 
 
341 aa  53.9  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  30.41 
 
 
224 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  35.59 
 
 
361 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  25.59 
 
 
587 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  38.64 
 
 
370 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
715 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  23.74 
 
 
276 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  32.56 
 
 
310 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  42.35 
 
 
306 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  29.55 
 
 
401 aa  51.2  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  29.1 
 
 
334 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  38.37 
 
 
386 aa  50.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  24.06 
 
 
475 aa  50.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  37.63 
 
 
330 aa  50.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  30.34 
 
 
270 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 
299 aa  50.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  37.78 
 
 
201 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  34.67 
 
 
488 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  26.76 
 
 
293 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  35.29 
 
 
366 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  26.4 
 
 
233 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
637 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  28.44 
 
 
214 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  32.04 
 
 
332 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  22.61 
 
 
289 aa  47.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  34.12 
 
 
294 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.06 
 
 
751 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  26.32 
 
 
237 aa  47  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  25.69 
 
 
225 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  25.25 
 
 
692 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  26.36 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  27.83 
 
 
225 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  32.06 
 
 
510 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  34.09 
 
 
324 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  34.83 
 
 
381 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  22.94 
 
 
517 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  22.77 
 
 
952 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  35.71 
 
 
331 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  35.63 
 
 
351 aa  44.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  24.11 
 
 
1196 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  36.25 
 
 
262 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  30.22 
 
 
253 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 
324 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  28.44 
 
 
226 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
367 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  26.29 
 
 
862 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 
882 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.09 
 
 
892 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  32.46 
 
 
1492 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  34.52 
 
 
337 aa  43.9  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>