More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0298 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  100 
 
 
368 aa  748    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  44.14 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  44.29 
 
 
375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  45.95 
 
 
377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  42.93 
 
 
368 aa  299  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  43.01 
 
 
391 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  42.78 
 
 
368 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  41.98 
 
 
381 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  40.71 
 
 
368 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  42.74 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  42.03 
 
 
368 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  43.56 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  42.62 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  41.03 
 
 
375 aa  282  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  41.46 
 
 
372 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  44.38 
 
 
374 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  40.92 
 
 
372 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  42.44 
 
 
378 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  40.92 
 
 
372 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  40.92 
 
 
372 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  40.65 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  40.65 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  40.65 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  40.65 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  40.65 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  40.65 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  38.31 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  40.65 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  40.92 
 
 
374 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  41.1 
 
 
360 aa  272  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  40.65 
 
 
372 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  43.06 
 
 
372 aa  270  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  39.89 
 
 
377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  39.61 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  42.35 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  38.61 
 
 
389 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  37.91 
 
 
368 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  37.87 
 
 
365 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  40.58 
 
 
379 aa  248  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  38.72 
 
 
377 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  38.72 
 
 
377 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  37.17 
 
 
374 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  35.93 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  29.62 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  28.99 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  27.72 
 
 
401 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  27.52 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  24.88 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  28.95 
 
 
409 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  28.65 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  28.71 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  28.65 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  26.49 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  26.85 
 
 
408 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  26.72 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  26.85 
 
 
408 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  26.85 
 
 
408 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  28.65 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  26.85 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  28.65 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  26.72 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  26.85 
 
 
408 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  28.06 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  26.85 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  26.53 
 
 
422 aa  86.3  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  30.26 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1755  peptidase M20  27.67 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  26.74 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.17 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  24.29 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  26.09 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  28.06 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  25.22 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  28.57 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  25.36 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  29.13 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  29.03 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  23.24 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  25.07 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  25.07 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  25.36 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  25.22 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  25.22 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  26.63 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  27.62 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  25.92 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  26.82 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  24.78 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  25.17 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  24.78 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  24.78 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.01 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  25 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  24.78 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  25.07 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  28.72 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  25.44 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.75 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  28.87 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  24.16 
 
 
422 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>