More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1392 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
386 aa  777    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  48.73 
 
 
398 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  50.99 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  45.82 
 
 
394 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  41.48 
 
 
419 aa  302  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  42.54 
 
 
402 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  41.69 
 
 
399 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  41.41 
 
 
404 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  40.85 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.56 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  40.21 
 
 
392 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  43.99 
 
 
405 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  42.51 
 
 
390 aa  269  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  42.05 
 
 
384 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  40.45 
 
 
374 aa  265  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  41.53 
 
 
387 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  39.29 
 
 
390 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  40.93 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  39.12 
 
 
375 aa  252  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  41.36 
 
 
370 aa  252  9.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  41.16 
 
 
387 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  38.79 
 
 
386 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  38.28 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  40.67 
 
 
385 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  38.1 
 
 
378 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  39.77 
 
 
370 aa  239  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  39.49 
 
 
370 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  38.73 
 
 
386 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  36.56 
 
 
371 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 
384 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  35.05 
 
 
376 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  37.15 
 
 
376 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
378 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.82 
 
 
388 aa  209  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 
375 aa  203  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  36.49 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  34.4 
 
 
383 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
392 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  34.1 
 
 
388 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  34.45 
 
 
381 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  36.65 
 
 
395 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 
397 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 
393 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 
372 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
380 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 
383 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
372 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.7 
 
 
399 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.68 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.89 
 
 
395 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.12 
 
 
371 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  31.84 
 
 
372 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.11 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.53 
 
 
370 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
371 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  33.24 
 
 
391 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  35.18 
 
 
382 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.72 
 
 
369 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.72 
 
 
369 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.72 
 
 
369 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 
396 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.09 
 
 
371 aa  159  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
371 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 
368 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
383 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
386 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  36.34 
 
 
367 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
422 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  32.19 
 
 
393 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  31.12 
 
 
814 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 
380 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.56 
 
 
399 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.95 
 
 
397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
397 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 
397 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.35 
 
 
385 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  38.41 
 
 
367 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
372 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 
397 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 
397 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
401 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  33.14 
 
 
368 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  33.43 
 
 
368 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 
382 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  33.73 
 
 
368 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
399 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  31.83 
 
 
373 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
372 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 
419 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  32.76 
 
 
373 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
398 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>