145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3963 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3963  formyl transferase  100 
 
 		 558 aa  1143    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4101  formyl transferase-like  64.42 
 
 		 565 aa  755    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1541  formyl transferase-like protein  65.09 
 
 		 579 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00137712  normal  0.223229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2013  formyl transferase domain-containing protein  54.26 
 
 		 575 aa  605  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2809  putative sensor protein  55.04 
 
 		 591 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1957  formyl transferase domain-containing protein  50.58 
 
 		 602 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3348  formyl transferase-like protein  47.29 
 
 		 588 aa  525  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2450  formyl transferase domain-containing protein  52.14 
 
 		 590 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0525  hydrogenase regulation HoxX  45.45 
 
 		 565 aa  458  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1425  NiFe-hydrogenase maturation factor, HypX/HoxX type  38.31 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  39.03 
 
 		 564 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00720  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 		 955 aa  204  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 286 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1209  formyl transferase domain-containing protein  34.8 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.111228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  26.03 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  25.57 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  25.57 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  26.03 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  25.57 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  26.03 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  25.57 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  23.53 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  25.26 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  24.35 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  25.23 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  29.26 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  23.42 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  20.97 
 
 		 317 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  21.99 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  24.15 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  24.23 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  23.39 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  23.29 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  21.36 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  22.98 
 
 		 318 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  22.47 
 
 		 327 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  29.02 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  25.54 
 
 		 327 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  23.18 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  22.67 
 
 		 327 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  22.73 
 
 		 312 aa  54.7  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  23.81 
 
 		 327 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  30.41 
 
 		 313 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  23.81 
 
 		 327 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 		 328 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  21.93 
 
 		 319 aa  54.3  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  25.13 
 
 		 313 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  23.18 
 
 		 330 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  23.18 
 
 		 330 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  22.18 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  22.58 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  24.18 
 
 		 307 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  22.18 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  22.63 
 
 		 311 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  21.49 
 
 		 323 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  24.77 
 
 		 325 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  23.14 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  26.09 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  24.36 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  24.22 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  27.33 
 
 		 306 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  24.64 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 		 267 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  23.23 
 
 		 323 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  22.58 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  24.03 
 
 		 308 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1035  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  23.92 
 
 		 259 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  24.28 
 
 		 316 aa  48.5  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0615  formyl transferase domain protein  24.85 
 
 		 331 aa  47.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66152  normal  0.206084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  25.11 
 
 		 319 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  20.54 
 
 		 314 aa  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  27.4 
 
 		 254 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2750  enoyl-CoA hydratase  26.67 
 
 		 254 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  22.52 
 
 		 311 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.69 
 
 		 261 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 		 262 aa  47  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 262 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  25.93 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  22.28 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  22.68 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.45 
 
 		 255 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0385  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.52 
 
 		 243 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  26.71 
 
 		 325 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1412  putative formyltransferase  24.54 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  27.6 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  23.48 
 
 		 311 aa  46.2  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  30.63 
 
 		 263 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  24.22 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  24.53 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  22.12 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  28.37 
 
 		 283 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 		 314 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  25.58 
 
 		 301 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  23.87 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  23.87 
 
 		 307 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1771  putative formyltransferase  24.4 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 		 258 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>