More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1425 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1425  NiFe-hydrogenase maturation factor, HypX/HoxX type  100 
 
 		 546 aa  1129    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3348  formyl transferase-like protein  43.73 
 
 		 588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4101  formyl transferase-like  37.73 
 
 		 565 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0525  hydrogenase regulation HoxX  39.13 
 
 		 565 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2013  formyl transferase domain-containing protein  38.61 
 
 		 575 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3963  formyl transferase  38.31 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1541  formyl transferase-like protein  38.96 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00137712  normal  0.223229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2809  putative sensor protein  36.51 
 
 		 591 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1957  formyl transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 602 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  35.26 
 
 		 564 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2450  formyl transferase domain-containing protein  34.52 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00720  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 		 955 aa  219  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1209  formyl transferase domain-containing protein  32.55 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.111228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2552  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.44 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.309894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.84 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  25.62 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  23.18 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.06 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.69 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0234  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.57 
 
 		 691 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.18 
 
 		 256 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  24.86 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.78 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  26.2 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  26.34 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  23.35 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  24.43 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1035  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  25.73 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.79 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.31 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 		 287 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2953  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  25.73 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 		 260 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  22.76 
 
 		 319 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.85 
 
 		 263 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  23.11 
 
 		 311 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2135  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  24.26 
 
 		 686 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948561  normal  0.0173218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  28.71 
 
 		 264 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  21.47 
 
 		 327 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.48 
 
 		 260 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1610  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.1 
 
 		 266 aa  55.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  23.92 
 
 		 320 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  29.56 
 
 		 258 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 		 261 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 		 301 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  29.45 
 
 		 270 aa  53.9  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  25 
 
 		 276 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  26.62 
 
 		 259 aa  53.5  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.47 
 
 		 262 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25 
 
 		 237 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.85 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.92 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 260 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2643  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.9 
 
 		 660 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28 
 
 		 262 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000176204  normal  0.426622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.03 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  30.06 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  25.95 
 
 		 266 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 260 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  30.26 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 		 298 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  27.45 
 
 		 264 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  27.84 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 260 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.62 
 
 		 255 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.3 
 
 		 279 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  26.95 
 
 		 277 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.03 
 
 		 260 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  21.59 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1117  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.66 
 
 		 259 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.74 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  28.71 
 
 		 263 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0332  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.27 
 
 		 278 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.15 
 
 		 266 aa  52  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  23.59 
 
 		 251 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 263 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 263 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 263 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  25.93 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  27.16 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1071  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 		 262 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0935  enoyl-CoA hydratase  29.24 
 
 		 262 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.220694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.96 
 
 		 260 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 263 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 		 302 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  26.58 
 
 		 659 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 		 263 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  26.95 
 
 		 277 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.17 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 267 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  26.95 
 
 		 277 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>