49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2809 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2809  putative sensor protein  100 
 
 		 591 aa  1184    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1957  formyl transferase domain-containing protein  65.1 
 
 		 602 aa  728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4101  formyl transferase-like  56.16 
 
 		 565 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2450  formyl transferase domain-containing protein  62.14 
 
 		 590 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1541  formyl transferase-like protein  58.06 
 
 		 579 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00137712  normal  0.223229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3963  formyl transferase  55.21 
 
 		 558 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2013  formyl transferase domain-containing protein  53.14 
 
 		 575 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3348  formyl transferase-like protein  42.91 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0525  hydrogenase regulation HoxX  42.66 
 
 		 565 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1425  NiFe-hydrogenase maturation factor, HypX/HoxX type  36.51 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  40.72 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.88 
 
 		 572 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00720  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 		 955 aa  253  9.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1209  formyl transferase domain-containing protein  31.54 
 
 		 284 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.111228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 286 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  33.15 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  33.54 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  33.54 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  33.54 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0641  methionyl-tRNA formyltransferase  24.49 
 
 		 310 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3669  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 		 243 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 285 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 		 261 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0312  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.57 
 
 		 264 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305978  normal  0.0108987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 260 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 		 251 aa  50.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4822  formyl transferase domain protein  28.33 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0280468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13439  hypothetical protein  31.03 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.524316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 		 276 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  27.39 
 
 		 263 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2572  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 310 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.14 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 		 260 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  20.88 
 
 		 314 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.13 
 
 		 258 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  25.12 
 
 		 311 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 263 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  28.41 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  20.48 
 
 		 314 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2339  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.43 
 
 		 686 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313709  normal  0.0822836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  33.12 
 
 		 261 aa  44.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1748  short chain enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 		 258 aa  44.3  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2552  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.55 
 
 		 281 aa  44.3  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.309894  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4186  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.92 
 
 		 269 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0308671  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  21.69 
 
 		 310 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  22.67 
 
 		 318 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3203  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 		 286 aa  43.9  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.79 
 
 		 267 aa  43.9  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>