More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13439 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13439  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  484  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.524316 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2015  putative formyltransferase  36.9 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0682294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  29.35 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3012  formyl transferase domain-containing protein  27.84 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2151  nonribosomal peptide synthetase  36.9 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0428065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1995  putative formyltransferase  36.9 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.399751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  31.58 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  40.23 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  32.48 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.11 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  27.81 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0319  formyl transferase domain-containing protein  31.67 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4420  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.77 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  27.49 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  33.98 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14917  predicted protein  35.78 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361751  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  27.59 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  26.71 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0065  methionyl-tRNA formyltransferase  30.83 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  35.23 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  29.27 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2468  formyl transferase domain protein  32.99 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0908762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2763  formyl transferase domain protein  32.99 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  27.87 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2244  formyl transferase domain protein  30.28 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  32.14 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  30.34 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  31.46 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  30.84 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  36.14 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2025  Formyl transferase-like  29.61 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.45542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  27.32 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2540  formyl transferase domain-containing protein  34.02 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  31.36 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  27.22 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  31.36 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  31.36 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  32.74 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  31.36 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  27.33 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  28.32 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  27.33 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  27.01 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0279  formyl transferase domain protein  30.63 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  31.96 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  32.52 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  31.96 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3305  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.69 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  31.48 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2691  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  25.2 
 
 		 664 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  27.27 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  28.44 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  31.86 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  30.19 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  27.7 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  29.33 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.97 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  29.05 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  25.54 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  32.71 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  28.97 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  33.64 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  23.81 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  29.53 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  29.53 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  26.92 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  35.96 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  29.53 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  27.81 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2129  methionyl-tRNA formyltransferase-like  27.27 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.96137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  27.1 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2588  formyl transferase domain protein  29.2 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  29.53 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2599  formyl transferase domain protein  29.37 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4226  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.21 
 
 		 663 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.98 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  29.53 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  30.65 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>