78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1271 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 429 aa  847    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  37.72 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 		 422 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  32.33 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  32.33 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  32.46 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  33.82 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  33.73 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  29.35 
 
 		 473 aa  162  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  29.25 
 
 		 488 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  28.39 
 
 		 488 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  28.39 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  25.54 
 
 		 488 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  26.14 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  26.14 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  26.14 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  26.14 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  26.14 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  28.12 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.22 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 504 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.42 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 507 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  29.11 
 
 		 520 aa  53.5  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  33.88 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  20.78 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  20.45 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 502 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  20.27 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  21.04 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  35.44 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 458 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.19 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 494 aa  46.6  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  19.94 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 586 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  30.47 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.09 
 
 		 483 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 487 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>