More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0401 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
103 aa  213  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2994  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3272  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0876  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2913  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850345  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2130  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  30.36 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1359  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  30.23 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4519  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
337 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
120 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
102 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  32.67 
 
 
120 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01497  hypothetical protein  34.67 
 
 
98 aa  50.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02582  hypothetical protein  34.67 
 
 
98 aa  50.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08198  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  26.14 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  33.73 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  35.29 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
437 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  38.03 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  35.29 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  34.57 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1295  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  34.92 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  28.38 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
125 aa  48.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  31.76 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
355 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  29.89 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>