More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0255 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0255  putative phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 409 aa  840    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  60.19 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  60.44 
 
 		 416 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0781  putative phenylacetate-CoA ligase  60.77 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3613  putative phenylacetate-CoA ligase  60.19 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  59.22 
 
 		 415 aa  498  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  58.98 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  59.95 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  57.69 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  59.18 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  59.56 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  62.04 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  56.9 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1866  coenzyme F390 synthetase  59.36 
 
 		 440 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  58.01 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2719  putative phenylacetate-CoA ligase  56.8 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0220  putative phenylacetate-CoA ligase  54.59 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2605  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  54.79 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  54.43 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3131  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  53.43 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1837  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  51.93 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0779546  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  52.08 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  53.79 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3411  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  50.36 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.79511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  50.49 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  52.55 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  52.31 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  52.84 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5040  putative phenylacetate-CoA ligase  51.85 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0294  putative phenylacetate-CoA ligase  52.35 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  51.47 
 
 		 406 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4001  phenylacetate-CoA ligase, putative  49.14 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  45.99 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  39.61 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  44.69 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  39.61 
 
 		 421 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  42.9 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  39.42 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  39.37 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  42.34 
 
 		 421 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  39.33 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2429  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.29 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.756333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  36.41 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.39 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  36.02 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.4 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  36.26 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  30.21 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  33.33 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  32.29 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  32.62 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  32.19 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  32.62 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  31.9 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  32.38 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  32.38 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  32.38 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  32.72 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  30.71 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  32.2 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  34.2 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  32.22 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  30.63 
 
 		 442 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.16 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  31.55 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  32.11 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  32.28 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  29.97 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.72 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  30.34 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  32.18 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.02 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  29.22 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  31.38 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  31.38 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  29.2 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  31.41 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  32.63 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  30.27 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  29.13 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  32.45 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  29.9 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  30.5 
 
 		 444 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  30.19 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  28.36 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  31.58 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  28.82 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  30.93 
 
 		 433 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  30.3 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  28.31 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  31.38 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  30.26 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  28.61 
 
 		 439 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  30.59 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  30.05 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  30.24 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  32.66 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  31.27 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>