More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3070 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 166 aa  343  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  72.33 
 
 		 167 aa  237  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  67.8 
 
 		 176 aa  227  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  63.37 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  75 
 
 		 174 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  64.24 
 
 		 190 aa  217  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  64.77 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  64.77 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  64.77 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  65.27 
 
 		 171 aa  215  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  67.08 
 
 		 167 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  73.13 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  72.39 
 
 		 165 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  65.5 
 
 		 171 aa  214  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  66.46 
 
 		 167 aa  213  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  63.41 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  74.63 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  66.87 
 
 		 198 aa  210  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  62.65 
 
 		 166 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  66.08 
 
 		 171 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  61.73 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  61.35 
 
 		 161 aa  206  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  64.33 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  61.96 
 
 		 167 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  59.01 
 
 		 164 aa  204  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.45 
 
 		 161 aa  203  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  63.25 
 
 		 161 aa  203  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  60.24 
 
 		 160 aa  197  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  56.52 
 
 		 164 aa  194  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  67.72 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  61.88 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  66.14 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  55.49 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  59.51 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  69.11 
 
 		 138 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  70.49 
 
 		 136 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  69.11 
 
 		 138 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  60.96 
 
 		 155 aa  187  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 152 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  68.85 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 135 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  61.33 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  57.67 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 164 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  52.12 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  56.25 
 
 		 151 aa  177  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.33 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  62.9 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  54.67 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  53.38 
 
 		 164 aa  170  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  59.4 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  50.31 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  62.99 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  53.42 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  55.86 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 		 183 aa  163  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  59.68 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  57.66 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  52.74 
 
 		 155 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  64.71 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  58.96 
 
 		 134 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 132 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  58.96 
 
 		 134 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  64.71 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  50.9 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 180 aa  157  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  59.5 
 
 		 133 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  58.54 
 
 		 130 aa  154  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.69 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  57.02 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  51.77 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 		 138 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 137 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  56.69 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  47.79 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  52.59 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>