37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1692 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  67.34 
 
 
262 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  29.79 
 
 
239 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  32.32 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  33.67 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  29.66 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  30.67 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  26.27 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  26.67 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  30.77 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  27.51 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  32.67 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  24.75 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  26.37 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  28.49 
 
 
185 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  22.46 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  32.8 
 
 
334 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  27.27 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  26.61 
 
 
227 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  28.37 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26403  predicted protein  27.94 
 
 
621 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00293247  decreased coverage  0.00469523 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  26.75 
 
 
330 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  26.75 
 
 
330 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  29.22 
 
 
167 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  27.16 
 
 
302 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  26.58 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  27.38 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  26.05 
 
 
663 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.98 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  24.27 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  23.48 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  23.12 
 
 
352 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  26.63 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.41 
 
 
272 aa  42  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 
268 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>