237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0773 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0773  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.878372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0372  uracil-DNA glycosylase  87.01 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0363  uracil-DNA glycosylase  87.45 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1846  uracil-DNA glycosylase  79.49 
 
 		 240 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963093  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0587  uracil-DNA glycosylase  81.14 
 
 		 241 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0580  uracil-DNA glycosylase  78.79 
 
 		 239 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3648  uracil-DNA glycosylase  74.46 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4450  uracil-DNA glycosylase  73.04 
 
 		 249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0313776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3600  uracil-DNA glycosylase  60.34 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0245858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3875  uracil-DNA glycosylase  53.67 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  57.21 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  55.81 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  55.56 
 
 		 233 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3459  uracil-DNA glycosylase  58.41 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 		 241 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 230 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  48.86 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  48.96 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2887  uracil-DNA glycosylase  46.88 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  54.84 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 		 223 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 308 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  47.5 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  54 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  50.94 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  48.61 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  50.71 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  49.31 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  47.75 
 
 		 221 aa  188  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  41.82 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  45.49 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  47.39 
 
 		 222 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  45.49 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 		 225 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  47.22 
 
 		 225 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  48.82 
 
 		 225 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 221 aa  185  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  46.85 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 		 234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  43.86 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  48.68 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  48.34 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 		 224 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  48.54 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  50.25 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  45.58 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  44.19 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 225 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  48.02 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 		 221 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  48.15 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  46.98 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 222 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  42.47 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  51.76 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  43.38 
 
 		 221 aa  178  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 		 221 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>