237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3648 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3648  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0580  uracil-DNA glycosylase  81.66 
 
 		 239 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4450  uracil-DNA glycosylase  86.82 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0313776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0587  uracil-DNA glycosylase  80.26 
 
 		 241 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1846  uracil-DNA glycosylase  73.91 
 
 		 240 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963093  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0773  uracil-DNA glycosylase  74.46 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.878372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0363  uracil-DNA glycosylase  73.57 
 
 		 237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0372  uracil-DNA glycosylase  74.11 
 
 		 237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3600  uracil-DNA glycosylase  63.56 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0245858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3459  uracil-DNA glycosylase  60.19 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  56.46 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  55.3 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  54.07 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  54.76 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3875  uracil-DNA glycosylase  51.71 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 263 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  52.61 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 231 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  53.14 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  51.83 
 
 		 271 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  47.6 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  54.37 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  48.34 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  53.27 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  51.38 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  52.38 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  51.46 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  51.9 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  47.89 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 301 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2887  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  51.67 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  50.72 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  49.76 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 		 301 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  49.04 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  45.24 
 
 		 216 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  47 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  51.4 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  51.16 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  45.85 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  49.28 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  51.42 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  45.97 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  44.6 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  45.12 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  52.33 
 
 		 224 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 		 225 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  47.73 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  45.12 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  47.69 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 218 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  52.08 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  46.7 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  50.72 
 
 		 227 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  49.27 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  49.76 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  53.48 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  53.48 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  54.1 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  54.1 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  45.67 
 
 		 222 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  54.1 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  54.1 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  52.33 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  51.21 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  53.48 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 222 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  54.1 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  54.1 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>