237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3459 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3459  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4450  uracil-DNA glycosylase  61.75 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0313776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3600  uracil-DNA glycosylase  60.43 
 
 		 250 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0245858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0580  uracil-DNA glycosylase  61.76 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3648  uracil-DNA glycosylase  60.19 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1846  uracil-DNA glycosylase  57.33 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963093  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0587  uracil-DNA glycosylase  57.78 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0773  uracil-DNA glycosylase  57.48 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.878372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0372  uracil-DNA glycosylase  57.21 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0363  uracil-DNA glycosylase  57.21 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3875  uracil-DNA glycosylase  56.88 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  51.95 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  53.07 
 
 		 304 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  51.52 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  53.07 
 
 		 304 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 268 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 305 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 305 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  52.17 
 
 		 301 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  50.65 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 271 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  49.56 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  50.87 
 
 		 229 aa  207  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  48.31 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 		 301 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  48.31 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  51.75 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  50.88 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  48.18 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  49.12 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  51.53 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  45.09 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  51.08 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  48.92 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  48.92 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2887  uracil-DNA glycosylase  48.48 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  45.29 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  48.44 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  49.57 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  44.35 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  46.36 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  45.09 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  44.84 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  47.94 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  47.77 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  46.22 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 219 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  45.09 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  47.32 
 
 		 253 aa  188  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  50.72 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  43.05 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  50.24 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  46.22 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  43.6 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  40.27 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  48.18 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  44.64 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  48.18 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  46.02 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  47.73 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>