More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0674 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0674  universal stress protein  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  99.56 
 
 		 287 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  88.99 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  90.31 
 
 		 287 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  96.1 
 
 		 598 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  97.4 
 
 		 598 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  94.81 
 
 		 598 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  28.62 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 597 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 449 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.68 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 595 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 593 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 597 aa  95.9  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 596 aa  95.9  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 591 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 591 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 597 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 591 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  28.9 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 591 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 587 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 592 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 589 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.95 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 590 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 590 aa  92.8  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 589 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 598 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 614 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 591 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 591 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 591 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 591 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 591 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 588 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 588 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 613 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 600 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 599 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 600 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 591 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.96 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 593 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 618 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 594 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 594 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 599 aa  89.7  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 597 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 594 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 592 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 604 aa  89.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 599 aa  89  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 596 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 601 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 596 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 605 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 594 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 583 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 623 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 590 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27 
 
 		 325 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 623 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 594 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 588 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  29 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 602 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 597 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 598 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 602 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 614 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 593 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 592 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 603 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 594 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 592 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 603 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 600 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 600 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 600 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 598 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 590 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 602 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 600 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 600 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 604 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 605 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 600 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>