222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3629 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
455 aa  935    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  55.66 
 
 
463 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  52.81 
 
 
446 aa  500  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  50.56 
 
 
446 aa  478  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  48.78 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  49.78 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  49.11 
 
 
450 aa  463  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  46.34 
 
 
448 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  46.12 
 
 
448 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  46.34 
 
 
448 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  45.09 
 
 
448 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  45.23 
 
 
448 aa  419  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  47.22 
 
 
451 aa  410  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  45.5 
 
 
446 aa  361  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 
447 aa  352  1e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
470 aa  330  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04171  malate:quinone oxidoreductase  24.72 
 
 
500 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129432  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 
508 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1753  malate:quinone oxidoreductase  22.29 
 
 
500 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04721  malate:quinone oxidoreductase  22.59 
 
 
508 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20971  malate:quinone oxidoreductase  24.33 
 
 
496 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  23.99 
 
 
404 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  25.49 
 
 
519 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  26.36 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  26.39 
 
 
545 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  26.45 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  25.27 
 
 
548 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  26 
 
 
545 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  26.42 
 
 
498 aa  83.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  25.09 
 
 
521 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  25.71 
 
 
576 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  27.27 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  24.73 
 
 
519 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
548 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  27.15 
 
 
552 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  27.21 
 
 
568 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  25.09 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  26.84 
 
 
550 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.81 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  24.72 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  25.09 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  26.74 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  25.28 
 
 
525 aa  80.9  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  26.47 
 
 
550 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  24.39 
 
 
517 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 
502 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  24.03 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  27.21 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  26.35 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  26.33 
 
 
493 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  26.96 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  27.08 
 
 
553 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  27.08 
 
 
553 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  24.61 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  24.18 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  25.63 
 
 
553 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  26.71 
 
 
547 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  28.68 
 
 
510 aa  77  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  27.37 
 
 
500 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  23.77 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  24.46 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  25.94 
 
 
545 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  26.62 
 
 
547 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0816  malate:quinone oxidoreductase  26.85 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720849  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  27.92 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  26.64 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  25.85 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  24.3 
 
 
502 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1584  malate:quinone oxidoreductase  28.73 
 
 
502 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  24.95 
 
 
540 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  26.62 
 
 
560 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  23.03 
 
 
509 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  26.11 
 
 
499 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  24.95 
 
 
523 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  26.58 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  23.92 
 
 
498 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 
500 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>