78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2857 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  89.9 
 
 		 100 aa  184  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  68.69 
 
 		 101 aa  140  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  55.1 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  47.92 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  44.9 
 
 		 99 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  45.83 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5749  putative PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5527  PadR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  29.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  29.63 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  32.22 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.39 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  35.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  40.45 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 124 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 109 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  33.72 
 
 		 125 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35.56 
 
 		 109 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  38.24 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  38.24 
 
 		 107 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  34.72 
 
 		 114 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 152 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 131 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  38.24 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  31.67 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 316 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>