More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1293 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  72.12 
 
 		 210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  72.12 
 
 		 211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  72.12 
 
 		 211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  71.43 
 
 		 210 aa  311  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  69.86 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  71.43 
 
 		 210 aa  308  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  70.67 
 
 		 210 aa  304  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  59.33 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  58.37 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  57.42 
 
 		 211 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  55.98 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  55.5 
 
 		 212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  55.5 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  57.5 
 
 		 210 aa  237  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  57.5 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  57.5 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  56.5 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  48.76 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  46.45 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  49.01 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.45 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.45 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  47.14 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  43.6 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  41.9 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  45.23 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  45.23 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  46.57 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.76 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  45.37 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 221 aa  168  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  48.88 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.33 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  45.67 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  43.75 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  43.06 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.43 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  42.92 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  45.27 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  42.11 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  45.27 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  43.81 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  41.52 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  41.9 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  46.33 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  42.72 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.57 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  44.27 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  38.69 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000698865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  45 
 
 		 200 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  45 
 
 		 200 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  51.16 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  37.91 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0455  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.035261  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000074471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0488  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114619  normal  0.070368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  42.57 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  41.35 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>