More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5134 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  78.32 
 
 
303 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.26 
 
 
316 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 
317 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.33 
 
 
298 aa  142  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.3 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  32.28 
 
 
241 aa  86.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  32.79 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.79 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.79 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.79 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.79 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.39 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.39 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  28.14 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.58 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0239  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000144523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  27.71 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.39 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  27.2 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
245 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.39 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.82 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  32.35 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  34.78 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  23.94 
 
 
328 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
193 aa  58.9  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
342 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  35.25 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
373 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.83 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  32.5 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  33.91 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  35.4 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  31.9 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  25.48 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.16 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  32.93 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  32.17 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  24.1 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.35 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
501 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  29.71 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
459 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.03 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  31.11 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  32.33 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  33.05 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  32.2 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>