58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3431 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3431  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1099    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2049  hypothetical protein  39.57 
 
 
746 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0191  hypothetical protein  41.23 
 
 
729 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.496537  normal  0.259383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2109  hypothetical protein  43.9 
 
 
761 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0190  hypothetical protein  41.76 
 
 
722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685735  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1914  hypothetical protein  41.72 
 
 
726 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.785676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4198  hypothetical protein  35.12 
 
 
881 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26199  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0536  hypothetical protein  39.39 
 
 
776 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664804  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4089  hypothetical protein  33.68 
 
 
702 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331742  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1334  hypothetical protein  40.3 
 
 
747 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3200  hypothetical protein  31.8 
 
 
824 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202972  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2744  hypothetical protein  35.71 
 
 
759 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  47.13 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4499  Collagen triple helix repeat protein  47.37 
 
 
326 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0524945  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  38.62 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  35.06 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  37.25 
 
 
328 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  36.63 
 
 
248 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  41.77 
 
 
250 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  42.47 
 
 
2914 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  52.83 
 
 
2851 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  41.46 
 
 
400 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  53.23 
 
 
953 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  56.6 
 
 
645 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  57.14 
 
 
1426 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  35.24 
 
 
382 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.37 
 
 
689 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  61.36 
 
 
582 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  54.9 
 
 
466 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  39.08 
 
 
403 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  56.82 
 
 
438 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  58.7 
 
 
253 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  33.04 
 
 
442 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  48.53 
 
 
366 aa  47.4  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  57.14 
 
 
451 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  57.14 
 
 
437 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  57.14 
 
 
437 aa  47  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  60.87 
 
 
158 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  60.87 
 
 
221 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  54.24 
 
 
1101 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  53.06 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  53.06 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  53.85 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  52.83 
 
 
839 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  57.78 
 
 
434 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5441  Collagen triple helix repeat protein  65.79 
 
 
296 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  57.5 
 
 
580 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  45.83 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  51.72 
 
 
344 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6234  putative collagen-like protein  58.14 
 
 
180 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  55.81 
 
 
426 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  50.91 
 
 
542 aa  44.3  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  51.92 
 
 
230 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  55.81 
 
 
295 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  70.97 
 
 
663 aa  43.9  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  61.36 
 
 
712 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  55.81 
 
 
462 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>