More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2740 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.863798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
260 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  0.0162871 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.1 
 
 
247 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.44 
 
 
247 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  33.98 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
253 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329406  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  38 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  38 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  38 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
266 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
270 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  38.65 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
269 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
256 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
246 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.668551  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
255 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
251 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
253 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
262 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
251 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2039  glucose 1-dehydrogenase, putative  37.74 
 
 
254 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
263 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
267 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1961  putative glucose 1-dehydrogenase  39.46 
 
 
254 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.536357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
254 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
250 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46093  decreased coverage  0.00000100027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.55 
 
 
246 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 
260 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
263 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
260 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  29.69 
 
 
263 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
274 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  32.66 
 
 
261 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
251 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.111569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
291 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
267 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
252 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  34.26 
 
 
257 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
269 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
266 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
245 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
268 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
263 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
255 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
253 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
260 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
241 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
258 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
254 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.15 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  33.47 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1837  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  32 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 
269 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
266 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.29 
 
 
260 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
261 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>