More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1881 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  100 
 
 
144 aa  297  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  196  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 
147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  193  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  193  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  193  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  193  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  192  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
143 aa  192  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60.14 
 
 
145 aa  192  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  191  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
150 aa  191  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  64.54 
 
 
145 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
143 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  190  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
147 aa  190  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  189  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  189  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  188  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 
146 aa  188  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 
146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 
143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
149 aa  187  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  58.45 
 
 
148 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  185  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  186  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  185  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
143 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  58.45 
 
 
147 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
147 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  185  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  185  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 
147 aa  184  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  58.33 
 
 
144 aa  184  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  184  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 
147 aa  184  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  59.15 
 
 
142 aa  184  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  183  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
144 aa  183  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  55.94 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  54.93 
 
 
147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  181  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  55.63 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>