100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0459 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  100 
 
 
137 aa  259  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0444  PilT domain-containing protein  52 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  36.84 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  37.41 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  29.01 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  30.77 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  38.17 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  32.67 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  27.13 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  27.13 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  25 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  36.17 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  32.35 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  34.62 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  25.95 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  32.65 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  30 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  39.13 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  36.45 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  30.69 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  27.48 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  30.69 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  34.34 
 
 
141 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  36.19 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  29.9 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  28.46 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  32.03 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  32.67 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.86 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  35.45 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  35.35 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  28.35 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0795  PilT protein-like protein  40 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  32.32 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  29.69 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  29.92 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  26.15 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  27.62 
 
 
134 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  36.59 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  26.15 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  25.74 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  34.41 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  26.92 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  35.42 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  28.57 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  28.57 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  30.83 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  25.98 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  28.57 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  38.05 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  36.51 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  30.23 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  33.33 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  31.43 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  36.56 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  29.84 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  29.03 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  34.85 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  28.35 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  33.98 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  31.07 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  36.56 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  36.04 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  34.41 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28.8 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  31.63 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  25.19 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  29 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  29.75 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  26.56 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  28.95 
 
 
130 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  32 
 
 
129 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  24.03 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  27.48 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  24.74 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  31.54 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  26.67 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  29.41 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  30 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  31.01 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  34.02 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  30.77 
 
 
146 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  29.17 
 
 
134 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  28.24 
 
 
140 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 
151 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>