More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1064 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  100 
 
 		 387 aa  785    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  57.11 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  48.94 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  51.21 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  46.79 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  45.89 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  45.62 
 
 		 380 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  44.62 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  42.64 
 
 		 395 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.81 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  43.68 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.38 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  43.23 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 384 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 381 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.11 
 
 		 392 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.38 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  43.24 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0924  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  42.02 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.38 
 
 		 384 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.38 
 
 		 400 aa  288  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.47 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.99 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.08 
 
 		 386 aa  286  5e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.9 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.51 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.27 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.58 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 393 aa  279  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  38.02 
 
 		 399 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.22 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40.11 
 
 		 1143 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.64 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  38.79 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.69 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.8 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.95 
 
 		 402 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.31 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.05 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  38.9 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  39.11 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  39.11 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  40.52 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  38.74 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  38.74 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  38.58 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.99 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  40.58 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  41.1 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.26 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.94 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  37.99 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  41.27 
 
 		 507 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  39.27 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  38.73 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  40.11 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  41.26 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  40.82 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  41.1 
 
 		 381 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.54 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  38.07 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.68 
 
 		 1139 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  38.85 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  38.9 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.68 
 
 		 394 aa  262  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.16 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  38.64 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  40.82 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  40.55 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.05 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.82 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  40.82 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>