More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0166 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
226 aa  474  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.09 
 
 
233 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.18 
 
 
227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
229 aa  234  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.07 
 
 
236 aa  177  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.08 
 
 
263 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.02 
 
 
236 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.32 
 
 
247 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.46 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.19 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.43 
 
 
263 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  33.33 
 
 
220 aa  104  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.76 
 
 
265 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.2 
 
 
268 aa  99  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.9 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  28.81 
 
 
229 aa  82  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  29.72 
 
 
259 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.05 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  39.37 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.1 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  27 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  35.2 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  33.33 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  33.33 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.71 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  32 
 
 
375 aa  68.6  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  32 
 
 
375 aa  68.6  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  35.82 
 
 
324 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  27.71 
 
 
361 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.21 
 
 
362 aa  68.2  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  33.6 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.34 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  33.33 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  34.17 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.44 
 
 
354 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  28.49 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.83 
 
 
354 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  31.93 
 
 
312 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  34.92 
 
 
323 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.87 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  32.85 
 
 
311 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  28.17 
 
 
354 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
354 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  28.17 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  28.17 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  30.77 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  32.77 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  36.59 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  32.85 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  36.07 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  34.19 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  27.62 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  35.83 
 
 
550 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.19 
 
 
374 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
390 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.6 
 
 
380 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  35.54 
 
 
347 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
407 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  32 
 
 
372 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.45 
 
 
355 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  35.43 
 
 
312 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  32.77 
 
 
352 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  31.2 
 
 
375 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  32.61 
 
 
317 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  33.06 
 
 
414 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  37.61 
 
 
314 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  31.75 
 
 
308 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.04 
 
 
445 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.37 
 
 
364 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.4 
 
 
386 aa  62  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  30.72 
 
 
383 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.5 
 
 
357 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  31.97 
 
 
387 aa  61.6  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  34.34 
 
 
380 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  28.18 
 
 
182 aa  61.6  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  31.93 
 
 
315 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  30.4 
 
 
314 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.2 
 
 
398 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  30.47 
 
 
326 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  32 
 
 
325 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  32.63 
 
 
379 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1527  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.45 
 
 
330 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000239897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  32.82 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  29.6 
 
 
385 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  30.4 
 
 
374 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  33.33 
 
 
368 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.4 
 
 
382 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.6 
 
 
360 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.27 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  29.6 
 
 
369 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  34.43 
 
 
363 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  31.58 
 
 
507 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  34.11 
 
 
353 aa  59.3  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  31.2 
 
 
398 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  37.78 
 
 
355 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  30.83 
 
 
438 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  32.76 
 
 
349 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.942315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>