173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2363 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  593  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  31.74 
 
 
312 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  32.75 
 
 
334 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  31.01 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
303 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  30.43 
 
 
286 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  27.64 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  27.04 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  27.44 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  25.65 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  27.41 
 
 
283 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  26.15 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  26.88 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  25.34 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  24.61 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  24.53 
 
 
299 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  27.69 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  27.62 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  28.03 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.59 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  25.71 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  25.71 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  25.71 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  25.71 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  25.71 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  25.71 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.36 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  29.61 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  26.62 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  27.59 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  28.78 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.32 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.26 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  24.2 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.21 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.4 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  23 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  23.57 
 
 
283 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.55 
 
 
395 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  26.18 
 
 
414 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  22.83 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  27.66 
 
 
301 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  22 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  22 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.55 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  22 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  22 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  33.03 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  24.53 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.33 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.55 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.55 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.55 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  25.99 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  26.46 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  22.67 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  25.54 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  22 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.45 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.79 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  25.61 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  25.61 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.55 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  26.55 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  26.07 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  26.35 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  25.37 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  25.37 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.3 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.58 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  28 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  24.11 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  24.64 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  30.45 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  27.7 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  23.81 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  22.38 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  27.7 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.65 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  23.86 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.15 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>