More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1902 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
288 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.93 
 
 
288 aa  344  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  43.9 
 
 
298 aa  222  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  42.31 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  42.86 
 
 
298 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.13 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  43.32 
 
 
294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.86 
 
 
298 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.94 
 
 
290 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  43.49 
 
 
289 aa  205  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.82 
 
 
284 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  43.7 
 
 
289 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  39.08 
 
 
314 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.21 
 
 
288 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.41 
 
 
285 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.46 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.86 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  41.84 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.36 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.88 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.26 
 
 
287 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.6 
 
 
287 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  37.86 
 
 
319 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.77 
 
 
311 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  36.71 
 
 
284 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  37.68 
 
 
315 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  39.3 
 
 
282 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  40.91 
 
 
289 aa  189  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  38.49 
 
 
289 aa  188  8e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  40.42 
 
 
286 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  40.29 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  40.65 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.37 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  37.1 
 
 
315 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  42.91 
 
 
285 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.15 
 
 
286 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.01 
 
 
283 aa  178  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.99 
 
 
294 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  38.03 
 
 
291 aa  177  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.25 
 
 
294 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  37.37 
 
 
286 aa  176  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  41.84 
 
 
294 aa  175  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  38.6 
 
 
294 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.93 
 
 
289 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  38.6 
 
 
294 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.1 
 
 
303 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  37.89 
 
 
294 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  37.28 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.07 
 
 
319 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  38.94 
 
 
286 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.87 
 
 
294 aa  146  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.45 
 
 
301 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.43 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.35 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  33.66 
 
 
301 aa  109  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.21 
 
 
302 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.63 
 
 
293 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  39.13 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  32.86 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  32.89 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.54 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.54 
 
 
333 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.69 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.72 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  25.9 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.45 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.43 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.91 
 
 
288 aa  82  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  29.63 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.02 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0744  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.88 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000571942  hitchhiker  0.00000066778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0592  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.88 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.94 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.2 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.32 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.69 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.91 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.78 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.83 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.59 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.5 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.13 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.3 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0625  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.07 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.03 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.74 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.44 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.62 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.27 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.33 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.56 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.15 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  23.53 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  24.8 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  23.53 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.66 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.1 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.03 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.63 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>