More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1450 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  40.15 
 
 
2503 aa  996    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  42.68 
 
 
2314 aa  1311    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 
2628 aa  1521    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  39.02 
 
 
2674 aa  1075    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  43.98 
 
 
2386 aa  1324    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  36.09 
 
 
2189 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  38.58 
 
 
2614 aa  1009    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  39.77 
 
 
2553 aa  1015    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  100 
 
 
2327 aa  4773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  44.47 
 
 
2816 aa  1182    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.73 
 
 
2249 aa  636  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  39.56 
 
 
1272 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.72 
 
 
2300 aa  608  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  34.47 
 
 
2266 aa  607  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  38.81 
 
 
1764 aa  587  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.24 
 
 
1772 aa  581  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.99 
 
 
2477 aa  583  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  37.96 
 
 
2298 aa  572  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.88 
 
 
2414 aa  567  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.1 
 
 
2443 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 
2560 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  37.42 
 
 
2664 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  37.67 
 
 
2620 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  37.68 
 
 
2619 aa  552  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  33.15 
 
 
2260 aa  550  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  37.04 
 
 
2693 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.04 
 
 
2694 aa  549  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  37.78 
 
 
2531 aa  546  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  37.28 
 
 
2642 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.32 
 
 
2704 aa  546  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  37.4 
 
 
2657 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.63 
 
 
2750 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  37.1 
 
 
2764 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  36.74 
 
 
2703 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  36.65 
 
 
2683 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  37.06 
 
 
2640 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 
2624 aa  535  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.47 
 
 
2661 aa  532  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  37.5 
 
 
2448 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  36.36 
 
 
2542 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.99 
 
 
1845 aa  517  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.13 
 
 
2771 aa  512  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  33.3 
 
 
3008 aa  485  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  34.83 
 
 
2338 aa  483  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.5 
 
 
3243 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.7 
 
 
2772 aa  452  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  34.34 
 
 
1631 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.7 
 
 
1656 aa  442  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.45 
 
 
1087 aa  434  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.58 
 
 
2316 aa  423  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  31.25 
 
 
1413 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.6 
 
 
2754 aa  414  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
2551 aa  410  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.59 
 
 
2551 aa  407  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  31.56 
 
 
1354 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.38 
 
 
3099 aa  401  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.18 
 
 
1349 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  33.18 
 
 
1349 aa  397  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 
2462 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  31.12 
 
 
3176 aa  397  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
1874 aa  393  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 
1587 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  31.63 
 
 
2333 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  32.78 
 
 
1909 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.16 
 
 
3252 aa  383  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.06 
 
 
4478 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.9 
 
 
1337 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  31.21 
 
 
1574 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  31.64 
 
 
1559 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  32.22 
 
 
1470 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  31.62 
 
 
2232 aa  380  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  32.17 
 
 
1929 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  31.05 
 
 
3130 aa  377  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.33 
 
 
1372 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.87 
 
 
1101 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.52 
 
 
1559 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  30.46 
 
 
1424 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 
1144 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  31.49 
 
 
1646 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  33.02 
 
 
2890 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  31.43 
 
 
1935 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  32.79 
 
 
1923 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 
7279 aa  367  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  31.77 
 
 
4080 aa  367  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  32.86 
 
 
2604 aa  367  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 
1653 aa  367  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  31.35 
 
 
3718 aa  367  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  31.54 
 
 
3930 aa  367  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.41 
 
 
1939 aa  364  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.89 
 
 
2762 aa  364  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.25 
 
 
6889 aa  363  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  30.23 
 
 
1408 aa  363  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  30.76 
 
 
1985 aa  363  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  30.92 
 
 
1489 aa  363  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  30.64 
 
 
1832 aa  362  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  32.23 
 
 
3696 aa  361  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.89 
 
 
7210 aa  359  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  32.25 
 
 
2085 aa  359  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  32.25 
 
 
2085 aa  359  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  31.52 
 
 
3449 aa  358  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>