More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0509 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0509  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 349 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  46.96 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  45.29 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2517  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0975  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 		 360 aa  96.3  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 535 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 381 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 860 aa  86.7  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  25.6 
 
 		 859 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25.81 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  25.52 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.88 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  25.52 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.32 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.17 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  27.72 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  25.82 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  29.53 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 850 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  30.08 
 
 		 1219 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  29.74 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2371  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0291756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  27.61 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.81 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  30.16 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  27.11 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.24 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  25.53 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 1241 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  25.19 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  27.21 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 1028 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  25.19 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.49 
 
 		 815 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>