More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0975 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0975  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 356 aa  721    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 		 356 aa  185  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0509  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2517  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 535 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 384 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 434 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.41 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  32.41 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.36 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  29.08 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.41 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.41 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.41 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.69 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.41 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.41 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.56 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 417 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.05 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 435 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 378 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.52 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  25.72 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  24.91 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  24.91 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.89 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30.63 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.43 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>