291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2083 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  100 
 
 		 372 aa  766    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  67.74 
 
 		 353 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  67.64 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  60.44 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  53.2 
 
 		 351 aa  401  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  54.52 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  47.35 
 
 		 351 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  45.56 
 
 		 345 aa  308  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  44.54 
 
 		 341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  47.78 
 
 		 349 aa  302  6.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  46.36 
 
 		 347 aa  299  6e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  46.06 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  45.07 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  44.82 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  42.14 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  42.64 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  43.5 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  42.69 
 
 		 348 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  43.2 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  44.98 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 		 346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  40.65 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  40.95 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  43 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  40.06 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  41.01 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  43 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  41.69 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  44.81 
 
 		 311 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  38.73 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  38.35 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  39.94 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  42.32 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  36.8 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  37.28 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  37.76 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  32.06 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  28.48 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.8 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.17 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.07 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.81 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  31.25 
 
 		 475 aa  82.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.27 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.27 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.61 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.72 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.4 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.5 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.73 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.86 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.02 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.99 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.25 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  24.5 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.84 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  27.37 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  24.58 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  26.57 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.65 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.82 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.69 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.27 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.62 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  25.25 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.58 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.76 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.51 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.29 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.13 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.75 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.8 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  27.98 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.2 
 
 		 479 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  21.2 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  21.2 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  26.91 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  22.71 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  22.97 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  26.12 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  23.84 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.84 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.08 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.95 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  25.6 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.65 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.95 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.85 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.33 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.71 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.71 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  24.58 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  24.72 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>