74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1806 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1207    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  36.11 
 
 
2490 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  36.11 
 
 
2490 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  36.11 
 
 
2358 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  36.11 
 
 
2358 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  35.71 
 
 
2490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  36.72 
 
 
2485 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  36.9 
 
 
2487 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  36.76 
 
 
2490 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  37.94 
 
 
2490 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  36.9 
 
 
2490 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  33.82 
 
 
5010 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  33.45 
 
 
5010 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  33.82 
 
 
5010 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  40.8 
 
 
2489 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  36.57 
 
 
5017 aa  107  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  33.45 
 
 
5010 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  36.57 
 
 
5017 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  36.57 
 
 
5017 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  35.75 
 
 
5017 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  35.75 
 
 
5017 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  39.43 
 
 
2520 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  36.69 
 
 
2121 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  38.89 
 
 
2520 aa  95.5  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  34.88 
 
 
2113 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  34.88 
 
 
1533 aa  94  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  36.11 
 
 
1857 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  31 
 
 
3602 aa  73.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  34.92 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3701  conserved repeat domain protein  35 
 
 
194 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.6 
 
 
4896 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.09 
 
 
1989 aa  67.4  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  34.95 
 
 
1293 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.46 
 
 
627 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  38.06 
 
 
1332 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.2 
 
 
3324 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.87 
 
 
3471 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  23.4 
 
 
2573 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  35.38 
 
 
983 aa  59.7  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  25.9 
 
 
1202 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.8 
 
 
3921 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  31.09 
 
 
1580 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  27.66 
 
 
3394 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 
1118 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  28.04 
 
 
2886 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  35.38 
 
 
826 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  26.63 
 
 
599 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  30.95 
 
 
587 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  26.89 
 
 
2418 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  32.33 
 
 
1898 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  30.46 
 
 
440 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  31.11 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  28.7 
 
 
907 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  30.82 
 
 
3911 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  31.54 
 
 
1059 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  28.68 
 
 
1067 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  35.23 
 
 
3486 aa  48.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  28.57 
 
 
2853 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  40 
 
 
3373 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  39.62 
 
 
2890 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  36.36 
 
 
801 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.27 
 
 
2000 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  26.17 
 
 
1757 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.44 
 
 
939 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  29.41 
 
 
1168 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  32.33 
 
 
546 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  25.81 
 
 
975 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  32.91 
 
 
924 aa  45.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  28.68 
 
 
1147 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  26.34 
 
 
4013 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  29.12 
 
 
1150 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  22.92 
 
 
1108 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  30.11 
 
 
965 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  30.11 
 
 
965 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>