35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0688 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  73.01 
 
 		 298 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  69.93 
 
 		 297 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  64.83 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  60.69 
 
 		 303 aa  358  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  63.19 
 
 		 288 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  55.08 
 
 		 319 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  36.07 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  25.16 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  23.45 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  25.99 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  23.87 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  23.4 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  25.84 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  25.23 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  24.2 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  29.32 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  24.71 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  29.6 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  26.09 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  24.72 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  27.65 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  22.88 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  22.77 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  24.48 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.36 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  25.1 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  31.48 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  23.44 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  21.73 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  33.08 
 
 		 340 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  26.57 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  30.77 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  22.89 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  24.65 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>