53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1394 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  53.72 
 
 
728 aa  780    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  53.68 
 
 
707 aa  770    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  56.84 
 
 
711 aa  823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  62.63 
 
 
726 aa  900    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  52 
 
 
727 aa  774    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  54.56 
 
 
704 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  50.5 
 
 
693 aa  720    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  100 
 
 
700 aa  1465    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  41.6 
 
 
677 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  41.74 
 
 
703 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  40.61 
 
 
697 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  41.6 
 
 
710 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  41.6 
 
 
710 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  41.6 
 
 
710 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  41.49 
 
 
702 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  41.74 
 
 
703 aa  538  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  41.7 
 
 
707 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  40.34 
 
 
672 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  41.32 
 
 
703 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  40.9 
 
 
699 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  41.74 
 
 
673 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  40.19 
 
 
727 aa  521  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  40.94 
 
 
676 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  40.14 
 
 
701 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  40.59 
 
 
684 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  39.63 
 
 
680 aa  502  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  38.85 
 
 
682 aa  498  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  39.68 
 
 
683 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  38.05 
 
 
703 aa  485  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  38.17 
 
 
606 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  31.9 
 
 
1255 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  27.79 
 
 
656 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.7 
 
 
656 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  26.66 
 
 
655 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  27.73 
 
 
678 aa  244  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  26.85 
 
 
659 aa  226  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  26.9 
 
 
682 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  27.46 
 
 
648 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  27.14 
 
 
647 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  27.22 
 
 
679 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  25.9 
 
 
674 aa  180  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  23.94 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  24.11 
 
 
643 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.45 
 
 
661 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  24.67 
 
 
571 aa  153  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  25.75 
 
 
574 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  25.35 
 
 
630 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.5 
 
 
629 aa  146  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.17 
 
 
649 aa  138  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.84 
 
 
641 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  23.55 
 
 
658 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.37 
 
 
648 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  21.59 
 
 
647 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>