53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0928 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  68.3 
 
 		 704 aa  1036    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  48.76 
 
 		 693 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  62.53 
 
 		 711 aa  931    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  55.77 
 
 		 726 aa  822    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  64.79 
 
 		 707 aa  989    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1532    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  53.72 
 
 		 700 aa  780    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  62.98 
 
 		 727 aa  959    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  40.62 
 
 		 677 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  40.44 
 
 		 672 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  40.34 
 
 		 701 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  41.13 
 
 		 673 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  40.75 
 
 		 676 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  38.46 
 
 		 707 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  38.53 
 
 		 703 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  38.1 
 
 		 697 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  38.37 
 
 		 703 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  37.87 
 
 		 680 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  39.38 
 
 		 683 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  38.08 
 
 		 682 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  38.23 
 
 		 703 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  38.23 
 
 		 703 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  38.68 
 
 		 699 aa  465  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  38.02 
 
 		 684 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  37.31 
 
 		 710 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  37.18 
 
 		 710 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  37.57 
 
 		 710 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  37.3 
 
 		 702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  37.02 
 
 		 727 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  37.7 
 
 		 606 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  32.85 
 
 		 1255 aa  318  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  27.59 
 
 		 682 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  25.65 
 
 		 678 aa  203  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  25.87 
 
 		 659 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  27.09 
 
 		 656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  26.97 
 
 		 647 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  25.87 
 
 		 656 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  26.92 
 
 		 648 aa  190  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  25.37 
 
 		 655 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  25.79 
 
 		 679 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  24.55 
 
 		 643 aa  177  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  23.45 
 
 		 615 aa  171  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.97 
 
 		 661 aa  151  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  24.36 
 
 		 571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  23.27 
 
 		 674 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  24.51 
 
 		 574 aa  127  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  23.76 
 
 		 649 aa  124  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  22.01 
 
 		 629 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  25.35 
 
 		 630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  21.87 
 
 		 647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  22.12 
 
 		 658 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  22.59 
 
 		 648 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  22.68 
 
 		 641 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>