More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1055 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 427 aa  828    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  51.07 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2305  amino acid permease-associated region  51.31 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  29.49 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  29.49 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.26 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  29.49 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.49 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.7 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 467 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.26 
 
 		 467 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29.82 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29.82 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.29 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  30.09 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.93 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  29.86 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  29.89 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  29.7 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  29.4 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  29.29 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 468 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.15 
 
 		 436 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.79 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 466 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.67 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 471 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  31.38 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 		 506 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.95 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.95 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.95 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.95 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.95 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.71 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.73 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  27.94 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  27.94 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  27.94 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  27.94 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  27.94 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  27.94 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  27.94 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.03 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 		 423 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  27.59 
 
 		 465 aa  133  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  27.71 
 
 		 467 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.9 
 
 		 466 aa  132  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.62 
 
 		 486 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.62 
 
 		 486 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 549 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  28.24 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.75 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.75 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  27.52 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.48 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.48 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.48 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  25.71 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.99 
 
 		 512 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  29.45 
 
 		 525 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 494 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.64 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 504 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 566 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.94 
 
 		 471 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.18 
 
 		 474 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>