More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0400 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  38.04 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1981  5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.87 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0936  stationary-phase survival protein SurE  35.42 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.371275  normal  0.06931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0881  stationary-phase survival protein SurE  37.31 
 
 
249 aa  152  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.704956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  36.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1952  stationary-phase survival protein SurE  35.32 
 
 
246 aa  149  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 
263 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  34.72 
 
 
264 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 
260 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  32.97 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  32.73 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  32.37 
 
 
265 aa  132  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.2 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  33.73 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
261 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  32.53 
 
 
248 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  32.46 
 
 
279 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 
264 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  32.79 
 
 
265 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  32.32 
 
 
252 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  34.26 
 
 
255 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  32.56 
 
 
257 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 
262 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  32.13 
 
 
253 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 
254 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  31.94 
 
 
264 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  31.18 
 
 
264 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  31.18 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 
252 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  34.66 
 
 
250 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  32.61 
 
 
262 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  32.61 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  32.56 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  32.56 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  34.88 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  32.39 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  32.97 
 
 
254 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 
260 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  32.43 
 
 
265 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
254 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  31.27 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  32.56 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  33.2 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  32.3 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  29.45 
 
 
259 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  31.33 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  32.14 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  30.2 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  31.75 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  30.57 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
249 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  31.6 
 
 
247 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  29.88 
 
 
258 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  30.04 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  31.56 
 
 
255 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  31.56 
 
 
253 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  30.56 
 
 
249 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  31.56 
 
 
255 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  31.56 
 
 
253 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  29.88 
 
 
258 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  32.13 
 
 
253 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  31.47 
 
 
247 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  31.35 
 
 
249 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  31.68 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  30.19 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  30.19 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  32.69 
 
 
252 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  32.66 
 
 
251 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  31.64 
 
 
247 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  31.56 
 
 
255 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  31.6 
 
 
242 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
251 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  31.47 
 
 
255 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  32.71 
 
 
253 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  33.6 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  29.55 
 
 
254 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  29.55 
 
 
254 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  29.55 
 
 
247 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  31.92 
 
 
252 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  31.94 
 
 
253 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  31.94 
 
 
253 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  32.08 
 
 
253 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  31.56 
 
 
253 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 
249 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  30.52 
 
 
252 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  32.13 
 
 
257 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  30.22 
 
 
252 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  29.55 
 
 
254 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>