More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2137 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2137  trigger factor  100 
 
 		 427 aa  868    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2292  trigger factor  74.65 
 
 		 427 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2564  trigger factor domain  69.72 
 
 		 426 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0272  trigger factor  65.48 
 
 		 436 aa  578  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1954  trigger factor  65.48 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.657393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2189  trigger factor  64.07 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.981322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0238  trigger factor  60.09 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  30.7 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  25.29 
 
 		 448 aa  133  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  24.13 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.44 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  26.25 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  25.98 
 
 		 435 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  27.43 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  25.46 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  26.71 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  26.89 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  24.24 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  24.94 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  24.88 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  27.2 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  24.42 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  24.94 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  24.65 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  23.95 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  24.31 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  25.06 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  24.65 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  26.07 
 
 		 434 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  25.68 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  24.25 
 
 		 444 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  26.4 
 
 		 441 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  24.41 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  25.26 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  25.34 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  25.26 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  25.26 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.41 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  23.8 
 
 		 434 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  24.42 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  24.71 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  24.38 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  25.85 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  24.94 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  25.85 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  25.85 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  25.85 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  25 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  23.45 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  25.11 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  23.86 
 
 		 440 aa  100  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  24.21 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  25.98 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  24.71 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  24.65 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  25.26 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  23.38 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  23.38 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  23.38 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  27.17 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  23.38 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  23.38 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  26.36 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  23.99 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  25.29 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  25.86 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  24.94 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  23.15 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  23.15 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  24.86 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  22.27 
 
 		 448 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  24.88 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  25.49 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  25.49 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  25.8 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  24.66 
 
 		 447 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  24.85 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  23.73 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  24.89 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  23.18 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  22.92 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  23.18 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  23.18 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  22.2 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  23.04 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1295  trigger factor  25.49 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.13 
 
 		 433 aa  93.2  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  25.89 
 
 		 427 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  24.16 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  25.96 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  24.77 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  24.22 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1671  trigger factor  20.77 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00079143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>