63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0950 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  40.4 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  40.7 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  34.39 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  31.94 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  36.02 
 
 		 432 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  35.58 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  30.77 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  29.32 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  28.5 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  28.5 
 
 		 267 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  31.43 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  31.43 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  30.43 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  35.19 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  35.19 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  30.21 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  32.21 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  31.11 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  27.96 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  29.78 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  39.78 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  31.45 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  30.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  30.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  30.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  30.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  30.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  29.79 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  29.6 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  29.6 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0788  yecA family protein  28.02 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  26.6 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  29.12 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  29.6 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  29.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  29.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  29.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  29.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  28.8 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01619  hypothetical protein  28.39 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  22.28 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  29.69 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  36.56 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003905  hypothetical protein  26.62 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  24.38 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  36.84 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4329  yecA family protein  24.22 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  31.43 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  29.57 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  25.82 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  29.01 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  29.01 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  22.6 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  22.6 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  22.6 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  22.6 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0305  yecA family protein  29.68 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  22.6 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0613  yecA family protein  26.52 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  45.65 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1908  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  29.23 
 
 		 146 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>